基因组de novo测序

基因组denovo测序即从头测序，是不依赖于任何参考序列对某物种进行测序，通过生物信息学分析手段进行拼接、组装，从而获得该物种全基因序列图谱。

应用领域

基因组survey评估

全基因组组装及注释

物种进化分析

分析内容

1.数据处理：去除接头序列、污染序列等；

2.基因组组装：原始数据统计、测序深度分析、覆盖度统计、GC含量分析等；

3.基因组注释：基因预测、基因功能注释、重复序列分析、非编码RNA注释等；

4.比较基因组学及进化分析：物种系统发育树构建、基因家族鉴定、基因共线性分析等

5.个性化分析。

客户需提供的测序样品

样品浓度≥200ng/uL；总量≥500ug；OD260/280 = 1.8~2.0。（所需的DNA量与所构建的文库数量以及文库类型有关）

项目周期

一般约7个月，具体完成时间视基因组大小及复杂程度而定。时间从样品检测合格开始计算，不包括由于样品问题而导致实验停滞的时间。