String 蛋白互作是一个搜索已知蛋白之间和预测蛋白质之间相互作用的系统。包括蛋白质直接物理的相互作用，也包括蛋白质之间间接功能相关性。数据包括：实验数据、从pubMed摘要中文挖掘结果和综合其他数据外，还有利用生物信息学方法预测有结果。所利用的生物学方法有：染色体临近，基因融合，系统进化树谱，和基因芯片数据的基因共表达。该系统用一个打分机制对不同方法得来结果给予一定权重，得到综合得分。

二、方法

1. 系统发生谱

2. 基因邻接

3. 基因融合事件

4. 镜像树

5. 突变关联

6. 序列信号关联

7. 保守的蛋白间相互作用

8. 同源结构复合物

9. 进化速率关联

10.共鸣识别模型MRRM预测蛋白质相互作用

11.通过Domain相互作用来预测蛋白质相互作用

12.根据蛋白结构来预测蛋白相互作用

需要的数据：关注的蛋白对应的蛋白质名称或氨基酸序列

返还的结果：蛋白互相作用网络图，可进一步性蛋白互作网络的关键基因分析。